Учреждение основано (архивные данные: приказ областного отдела народного образования от 21.03.1937 г. № 349) 1 апреля 1937 году как Хвалынский детский дом № 3.

Постановлением администрации Саратовской области  от 15.01.1996 года № 14 «О переводе на областной бюджет детских домов» зарегистрировано государственное образовательное учреждение «Хвалынский детский дом № 3 для детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей».

Согласно приказу министерства образования Саратовской области от 25.04.2007 г.  № 674  государственное образовательное учреждение «Хвалынский детский дом № 3 для детей – сирот и детей, оставшихся без попечения родителей» переименовано в Государственное образовательное учреждение для детей – сирот и детей, оставшихся без попечения родителей, «Детский дом № 3» г. Хвалынска Саратовской области.

На основании постановления Правительства Саратовской области от 29.11.2010 г. № 598-П «О создании государственных казенных учреждений Саратовской области» создано Государственное казенное образовательное учреждение Саратовской области для детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей, «Детский дом № 3 г.Хвалынска», которое является правопреемником Государственного образовательного учреждения  для детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей, «Детский дом №3» г. Хвалынска Саратовской области.

В соответствии с постановлением Правительства Саратовской области от 06.04.2015 г.  № 58-Пр «О создании государственных бюджетных учреждений Саратовской области путем изменения типа государственных казенных учреждений Саратовской области» создано государственное бюджетное учреждение  Саратовской области «Центр психолого-педагогического и медико-социального сопровождения детей» г.Хвалынска путем изменения типа существующего Государственного казенного образовательного учреждения   Саратовской области для детей-сирот и детей, оставшихся без попечения  родителей, «Детский дом № 3 г. Хвалынска».

Размещался детский дом до 1996 года в старом корпусе в здании четырехклассного мужского реального училища, где учился наш знаменитый земляк Кузьма Сергеевич Петров – Водкин.

Во время Великой Отечественной войны в детском доме воспитывались дети блокадного Ленинграда, оккупированной Белоруссии, Минска, Смоленска.

С 1996 года по 2001 год детский дом пережил период большого строительства. В итоге были созданы прекрасные условия для учебно-воспитательного процесса.